
- 2025-01-10 17:03:23酵母單雜交文庫篩選
- 酵母單雜交文庫篩選是一種研究DNA-蛋白質(zhì)相互作用的實(shí)驗(yàn)方法。它利用酵母細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)錄因子與DNA序列的特異性結(jié)合,將感興趣的DNA序列與報告基因融合,構(gòu)建文庫。通過篩選文庫,找到能與特定DNA序列結(jié)合的蛋白質(zhì),進(jìn)而研究其功能。該方法具有高效、靈敏、操作簡便等優(yōu)點(diǎn),廣泛應(yīng)用于基因調(diào)控、轉(zhuǎn)錄因子功能研究等領(lǐng)域。
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- 蛋白質(zhì)與DNA的相互作用在基因表達(dá)調(diào)控中起著至關(guān)重要的作用。了解哪些轉(zhuǎn)錄因子與特定DNA序列結(jié)合,進(jìn)而調(diào)控基因表達(dá),對于解碼復(fù)雜的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)至關(guān)重要。
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酵母單雜交文庫篩選問答
- 2025-04-10 14:00:16單臂跌落試驗(yàn)機(jī)怎么接線
- 單臂跌落試驗(yàn)機(jī)怎么接線 在產(chǎn)品的運(yùn)輸和包裝過程中,如何測試其抗跌落能力是至關(guān)重要的。單臂跌落試驗(yàn)機(jī)作為一種常見的測試設(shè)備,可以模擬產(chǎn)品在運(yùn)輸過程中可能遭遇的跌落情況,從而評估其抗損性。為了確保試驗(yàn)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性,正確接線單臂跌落試驗(yàn)機(jī)顯得尤為重要。本文將詳細(xì)介紹如何正確接線單臂跌落試驗(yàn)機(jī),確保設(shè)備正常運(yùn)行,并提升測試效果。 接線單臂跌落試驗(yàn)機(jī)之前,我們需要了解試驗(yàn)機(jī)的主要組成部分和各個端口的功能。單臂跌落試驗(yàn)機(jī)通常由控制系統(tǒng)、驅(qū)動系統(tǒng)、傳感器和操作面板組成。在接線過程中,需要將這些組件正確連接,確保信號能夠準(zhǔn)確傳輸,并避免因接線錯誤導(dǎo)致設(shè)備故障或數(shù)據(jù)異常。 接線步驟的步是檢查設(shè)備的電源接口,確保電源線和插座符合設(shè)備的電壓和功率要求。連接電源線時,注意檢查插頭是否牢固,電源線的絕緣層是否完好無損,以防電氣短路或觸電事故發(fā)生。 連接試驗(yàn)機(jī)的控制系統(tǒng)與驅(qū)動系統(tǒng)。控制系統(tǒng)通常通過信號線連接到驅(qū)動系統(tǒng)的輸入端口,負(fù)責(zé)對設(shè)備的動作進(jìn)行指令傳輸。在接線時,需要注意信號線的正確極性,避免極性接反導(dǎo)致控制信號無法正常傳輸。此時,還應(yīng)檢查信號線的質(zhì)量,確保其沒有磨損或破損。 單臂跌落試驗(yàn)機(jī)還配備了傳感器,用于實(shí)時監(jiān)測試驗(yàn)過程中的各項(xiàng)數(shù)據(jù),如跌落高度、速度以及沖擊力等。連接傳感器時,要確保傳感器與控制系統(tǒng)的通訊接口正確匹配,避免因?yàn)榻涌诓患嫒菰斐蓴?shù)據(jù)傳輸中斷。此時,還應(yīng)進(jìn)行傳感器校準(zhǔn),確保傳感器在測試過程中能夠準(zhǔn)確地收集和傳輸數(shù)據(jù)。 操作面板的連接至關(guān)重要。操作面板不僅是操控設(shè)備的主要界面,還是試驗(yàn)參數(shù)設(shè)置的重要工具。在接線時,需要確保所有的輸入和輸出接口都連接牢固,避免因接觸不良導(dǎo)致操作面板無法正常顯示或控制設(shè)備。 總結(jié)來說,單臂跌落試驗(yàn)機(jī)的接線工作需要遵循嚴(yán)謹(jǐn)?shù)牟襟E,確保電源、信號、傳感器及操作系統(tǒng)的正確連接。通過專業(yè)的接線操作,可以確保試驗(yàn)設(shè)備的穩(wěn)定運(yùn)行,從而提高測試結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。
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- 2023-01-10 12:42:52貝克曼庫爾特Biomek NGeniuS與IDT文庫制備自動化解決方案
- 隨著基因組測序和數(shù)據(jù)分析方法的廣泛普及,越來越多的實(shí)驗(yàn)室正在探索下一代測序(Next-Generation Sequencing,NGS)作為研究工具的可行性。然而,NGS文庫的手動制備過程單調(diào)乏味,根據(jù)所構(gòu)建文庫的類型而異,耗時從數(shù)小時到數(shù)天時間不等,并且操作過程中必須小心謹(jǐn)慎,以避免人工出錯導(dǎo)致的制備失敗,浪費(fèi)寶貴樣本。Biomek NGeniuS系統(tǒng)是一款全自動文庫制備系統(tǒng),幫助我們從第 一步即確保正確無誤。DNA樣品上機(jī),撥動轉(zhuǎn)盤,按下按鈕,運(yùn)行過程無需值守,每批次可支持運(yùn)行4-24任意數(shù)量的樣品,是實(shí)驗(yàn)室追求靈活性和自動化的理想之選。圖1 Biomek NGeniuS全自動文庫制備系統(tǒng)IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 便是一款支持自動化的試劑盒。該試劑盒提供高一致性的文庫制備方法,獨(dú)特的兩步連接法能夠有效抑 制接頭二聚體和模板DNA自連,因而可有效提高文庫轉(zhuǎn)換率,尤其適用于cfDNA和FFPE等低質(zhì)量樣品,有助于研究人員發(fā)現(xiàn)和表征腫瘤樣品中出現(xiàn)的低頻變異位點(diǎn)。圖2 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit工作流程我們使用Biomek NGeniuS系統(tǒng)對三種不同類型的樣品,cfDNA、FFPE和gDNA,分別構(gòu)建24個、10個和4個文庫。cfDNA 樣品所得文庫平均濃度為16.67ng/μL。cfDNA樣品連接后擴(kuò)增片段平均長度為362bp,長度分布一致且呈正態(tài)。與參考基因組相比,該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫比對率為99.49%,配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.84%。23份樣品中reads平均重復(fù)率為0.46%。圖3 以cfDNA為起始樣品,在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結(jié)果。FFPE樣品構(gòu)建的文庫平均片段長度為378 bp,長度呈正態(tài)分布。與參考基因組相比,該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫比對率為99.8%,配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.84%。10份樣品中reads平均重復(fù)率為0.37%。圖4 以FFPE DNA為起始樣品,在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結(jié)果。gDNA樣品制備的文庫平均片段長度為391bp,長度分布與 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 的預(yù)期一致。與參考基因組相比,該樣品組從 NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫的比對率為99.2%,配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.3%。3份樣品中reads平均重復(fù)率為0.56%。圖5 以gDNA為起始樣品,在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結(jié)果。在Biomek NGeniuS全自動文庫制備系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep kit構(gòu)建文庫,所得文庫片段大小分布一致,并符合IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit說明書建議的文庫大小范圍。對三種不同濃度的樣品重復(fù)進(jìn)行測序,結(jié)果表明,平均文庫大小為362~391bp。所獲文庫比對率>99.2%,配對的reads比對到參考基因組的比對率>99.3%,重復(fù)率
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- 2023-03-20 12:39:19厭氧菌、絲狀菌等的培養(yǎng)、篩選真的很難嗎?
- 新型益生菌高通量厭氧發(fā)酵技術(shù)及應(yīng)用我們使用BioLector XT對益生菌兩岐雙岐桿菌進(jìn)行厭氧分批培養(yǎng)和補(bǔ)料分批培養(yǎng),展示其操作的簡單易用性和可行性。您在做絲狀真菌嗎? ——利用BioLector高通量培養(yǎng)絲狀真菌BioLector系統(tǒng)適用于絲狀真菌如里氏木霉的高通量發(fā)酵,可獲得與傳統(tǒng)搖瓶發(fā)酵基本相同的形態(tài)、纖維素酶產(chǎn)量和生長動力。并且利用BioLector的光學(xué)在線測量能力可應(yīng)用于包括基于報告基因的纖維素酶誘導(dǎo)的估算以及生長速率的在線測量。微生物反應(yīng)器可以進(jìn)行細(xì)胞裂解、應(yīng)激及毒性篩選的測定嗎?BioLector XT高通量微型生物反應(yīng)器它可以同時進(jìn)行48個樣品的平行培養(yǎng),每個培養(yǎng)體積為微升級別,并可以在線檢測各種信號,實(shí)現(xiàn)靈活補(bǔ)料和PH調(diào)控,且整個過程無需人員值守。因此無需改變?nèi)魏闻渲茫图瓤梢詽M足微生物的高通量培養(yǎng),又可以進(jìn)行細(xì)胞裂解、應(yīng)激及毒性篩選的測定。
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- 2023-05-17 13:40:03AccuSizer 顆粒計(jì)數(shù)器用于蛋白質(zhì)配方篩選和 USP <787> 測試
- 全文共 1386 字,閱讀大約需要 5 分鐘AccuSizer? 自動顆粒計(jì)數(shù)分析儀可用于蛋白質(zhì)配方優(yōu)化,最 大程度地減少蛋白質(zhì)聚集并執(zhí)行 USP 亞可見顆粒物質(zhì)測試。簡介動態(tài)光散射 (DLS) 是檢測蛋白質(zhì)粒徑的標(biāo)準(zhǔn)工具,但該方法不提供濃度信息。AccuSizer? 單粒子光學(xué)傳感技術(shù) (SPOS) 系統(tǒng)可用于檢測聚集蛋白粒徑和濃度,可測量150nm以上的聚集蛋白濃度。圖 1 顯示了單抗產(chǎn)品熱應(yīng)激前后的 Nicomp? DLS 結(jié)果。加熱后的結(jié)果(藍(lán)色)顯示了高分辨率的多峰結(jié)果,包括從~150 nm開始的較大的聚集峰。AccuSizer 無法檢測到 10 nm 的顆粒,但可以提供 >150 nm聚集蛋白的定量數(shù)據(jù)。在這項(xiàng)研究中,AccuSizer FX Nano 用于研究各種配方穩(wěn)定化學(xué)物質(zhì)如何影響NIST標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的最 終聚集狀態(tài)。AccuSizer FX Nano也可用于 USP 亞可見顆粒物測試1。材料使用的蛋白質(zhì)是 NIST 標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì) 8671,批號 14HB-D002,NIST mAb,人源 IgG1k 單抗2。在Nicomp動態(tài)光散射(DLS)系統(tǒng)上,使用35mw激光二極管源,APD檢測器測量蛋白質(zhì)的初次粒徑。在配備兩個傳感器的AccuSizer FX Nano SIS系統(tǒng)上測量蛋白質(zhì)聚集體:LE-400; 0.5 – 400 μm 和 FX Nano; 0.15 – 10 μm.SIS進(jìn)樣器提供精確的樣品體積,最 小進(jìn)樣量低至100 μL且可回收。iFormulate3(圖 2)板預(yù)裝了配方,由 DoE 設(shè)計(jì)用于合理的配方開發(fā),用于測試配方的聚集水平。評估了蛋白配方的四個主要影響因素;pH、離子強(qiáng)度、緩沖液和穩(wěn)定劑濃度。使用的 iFormulate 板測試了以下影響因素:? pH:5 – 7.6? 離子強(qiáng)度:0 – 200 mM NaCl? 海藻糖穩(wěn)定劑:0 – 10 %? 緩沖液濃度:10 – 50 mM方法將 NIST mAb 解凍并稀釋至 1 mg/mL,將 160 μL 過濾的去離子水添加到 iFormulate 板的每個孔中。每孔加入40 μL NIST mAb。將培養(yǎng)皿置于60°C(剛好低于蛋白質(zhì)熔點(diǎn))的烤箱中24小時。使用 AccuSizer 顆粒計(jì)數(shù)器分析每個孔。將>0.15 μm(總)和>0.53 μm的顆粒計(jì)數(shù)數(shù)據(jù)提交給iformula,由iformula進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和穩(wěn)定性建模。結(jié)果數(shù)據(jù)使用帕累托分析方法處理,帕累托分析方法在多影響因素下十分有效。帕累托分析給出了影響因素排名和影響因素之間的相互作用。圖 3 和圖 4 分別顯示了 >0.15 μm 和 >0.53 μm 的帕累托分析。顏色表示配方變量對增加的顆粒計(jì)數(shù)的相對重要性,藍(lán)色 = 重要,灰色 = 臨界,紅色 = 不太重要。下面的結(jié)果顯示了不同條件下聚集效應(yīng)的 3D 響應(yīng)曲面圖。這種設(shè)計(jì)空間提供了通過檢測在兩個粒徑范圍內(nèi)顆粒濃度的方法,以此來確定可最 大限度減少聚集配方。圖 5 和圖 6 顯示了在保持緩沖液和 NaCl 濃度不變的情況下,改變 pH 值和穩(wěn)定劑(海藻糖)的結(jié)果。圖5 pH值和穩(wěn)定劑的影響>0.15μm圖6 pH值和穩(wěn)定劑的影響>0.53μm圖 7 和圖 8 顯示了不同 NaCl 和穩(wěn)定劑(海藻糖)濃度的結(jié)果,同時保持緩沖液濃度穩(wěn)定且 pH 值從 5.91 略微變化到 6.3。圖7 NaCl和穩(wěn)定劑的作用>0.15μm圖8 NaCl和穩(wěn)定劑的作用>0.53μm然后對這些結(jié)果以及此處未顯示的其他結(jié)果進(jìn)行整理,圖9和圖10顯示了最 小粒子數(shù)優(yōu)化圖。圖9 顆粒最 小化圖>0.15μm圖10 顆粒最 小化圖>0.53μm結(jié)論此處顯示的結(jié)果表明,可最 大程度減少顆粒計(jì)數(shù)并因此減少蛋白質(zhì)聚集的最 佳化學(xué)制劑為:pH = 6.1 – 6.3NaCl = 40 – 70 mM海藻糖 = 7 – 8%緩沖液 = 50 mMAccuSizer也可用于在≥10和25μm的條件下進(jìn)行USP<787>測試,并可使用A2000 USP微孔板分析儀實(shí)現(xiàn)自動化。
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- 2023-05-24 10:21:08單人和雙人超凈工作臺的區(qū)別
- 單人超凈工作臺與雙人超凈工作臺是一種供單人操作的通用型局部凈化設(shè)備,氣流形式為垂直層流,它可造就局部高清潔度空氣環(huán)境,是科研制藥、醫(yī)療衛(wèi)生、電子光學(xué)儀器等行業(yè)為理想的專用設(shè)備。 單人單面超凈工作臺與雙人雙面超凈工作用途:廣泛適用于醫(yī)藥衛(wèi)生、生物制藥、食品、醫(yī)學(xué)科學(xué)實(shí)驗(yàn)、光學(xué)、電子、無菌室實(shí)驗(yàn)、無菌微生物檢驗(yàn)、植物組培接種等需要局部潔凈無菌工作環(huán)境的科研和生產(chǎn)部門。超凈工作臺也可連接成裝配生產(chǎn)線具有低噪聲、可移動性等優(yōu)點(diǎn)。 超凈工作臺它是一種提供局部高潔凈度工作環(huán)境通用性較強(qiáng)的空氣凈化設(shè)備,它的使用對改善工藝條件,提高產(chǎn)品質(zhì)量和增大成品率均有良好效果。 單人超凈工作臺與雙人超凈工作臺使用方法: 超凈工作臺的優(yōu)點(diǎn)是操作方便自如,比較舒適,工作效率,預(yù)備時間短,開機(jī)10分鐘以上即可操作,基本上可隨時使用。在工廠化生產(chǎn)中,接種工作量很大,需 經(jīng)常長久地工作時,超凈臺是很理想的設(shè)備。 超凈工作臺由三相電機(jī)作鼓風(fēng)動力,功率145~260W左右,將空氣通過由特 的微孔泡沫塑料片層疊合組 的“超級濾清器”后吹送出來,形成連續(xù)不斷的無塵無菌的超凈空氣層流,即所謂“ 有效的特殊空氣”,它除去了大于0.3μm的塵埃、真菌和細(xì)菌孢子等等。 超凈工作臺空氣的流速為24~30m/min,這已足夠防止附近空氣可能襲擾而引起的污染,這樣的流速也不會妨礙采用酒精燈或本生燈對器械等的灼燒消。 工作人員就在這樣的無菌條件下操作,保持無菌材料在轉(zhuǎn)移接種過中不受污染。但是萬一操作中途遇到停電,暴露在未過濾空氣中的材料便難以幸免污染。 這時應(yīng)迅速結(jié)束工作,并在瓶上作出記號,內(nèi)中的材料如處增殖階段,則以后不再用作增殖而轉(zhuǎn)入生根培養(yǎng)。如為一般性生產(chǎn)材料,極其豐富也可棄去。如處生根過,則可留待以后種植用。 單人超凈工作臺與雙人超凈工作臺注意事項(xiàng): 超凈臺電源多采用三相四線,其中有一零線,連通機(jī)器外殼,應(yīng)接牢在地線上,另外三線都是相線,工作電壓是380V。三線接入電路中有一定的順序,如線頭接錯了,風(fēng)機(jī)會反轉(zhuǎn),這時聲音正常或稍不正常,超凈臺正面無風(fēng)(可用酒精燈火焰觀察動靜,不宜久試),應(yīng)及時切斷電源,只將其中任何兩相的線頭交換一下位置再接上,就可解決。 三相線如只接入兩相,或三相中有一相接觸不良,則機(jī)器聲音很不正常,應(yīng)立即切斷電源仔細(xì)檢修,否則會燒毀電機(jī)。這些常識應(yīng)在開始使用超凈臺時就向工作人員講解清楚,免除不應(yīng)造成事故與損失。 超凈臺進(jìn)風(fēng)口在背面或正面的下方,金屬網(wǎng)罩內(nèi)有一普通泡沫塑料片或無紡布,用以阻攔大顆粒塵埃,應(yīng)常檢查、拆洗,如發(fā)泡沫塑料老化,及時更換。 除進(jìn)風(fēng)口以外,如有漏氣孔隙,應(yīng)當(dāng)堵嚴(yán),如貼膠布,塞棉花,貼膠水紙等。工作臺正面的金屬網(wǎng)罩內(nèi)是超級濾清器,超級濾清器也可更換,如使用年久,塵粒堵塞,風(fēng)速減小,不能保證無菌操作時,則可換上新的。 超凈臺使用壽命的長短與空氣的潔凈度有。在溫帶地區(qū)超凈臺可在一般實(shí)驗(yàn)室使用,然而在熱帶或亞熱帶地區(qū),由大氣中含有量的花粉,或多粉塵的地區(qū),超凈臺則宜放在較好的有雙道門的室內(nèi)使用。任何情下不應(yīng)將超凈臺的進(jìn)風(fēng)罩對著開敞的門或窗,以免影響濾清器的使用壽命。 無菌室應(yīng)定期用70%酒精或0.5%苯酚噴霧降塵和消毒,用2%新潔爾滅抹拭臺面和用具(70%酒精也可),用福爾 馬林(40%甲醛)加少量**鉀定期密閉熏蒸,配合紫外線滅菌燈(每次開啟15分鐘以上)等等消毒滅菌手段,以使無菌室經(jīng)常保持度的無菌狀。 接種箱內(nèi)部也應(yīng)裝有紫外線燈,使用前開燈15分鐘以上照射滅菌,但凡是照射不到之處仍是有菌的。 在紫外線燈開啟時間較長時,可激發(fā)空氣中的氧分子締合成臭氧分子,這種氣分有很強(qiáng)的殺菌作用,可以對紫外線沒有直接照到的角落產(chǎn)生滅菌效果。由于臭氧有礙健康,在進(jìn)入操作之前應(yīng)先掉紫外線燈,后十多分鐘即可入內(nèi)。
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